Epidemiologia genomica di Salmonella Infantis in Europa. Il successo di Salmonella enterica serovar Infantis nelle produzioni animali in Europa e la sua associazione con uno specifico megaplasmide. Si tratta di un importante studio di epidemiologia genomica volto a chiarire vari aspetti del successo nell’ultimo decennio di Salmonella enterica serovar Infantis nelle produzioni animali in Europa e la sua associazione con uno specifico megaplasmide, è stato coordinato e pubblicato sulla rivista Microbial Genomics da parte della Direzione Operativa Diagnostica Generale, CRN per l’Antibioticoresistenza e NRL for Antimcrobial Resistance dell’IZSLT, in collaborazione con:EURL for Antimicrobial Resistance e WHO Collaborating Centre for Antimicrobial Resistance in Foodborne Pathogens and Genomics, DTU-Food Denmark; EFSA; e vari partners di altri otto paesi Europei. Lo studio è stato condotto nel contesto delle attività del Progetto Europeo EFSA “ENGAGE” (Establishing Next Generation Sequencing Ability for Genomic analysis in Europe, EFSA, GP/EFSA/AFSCO/2015/01/CT1). Nel corso del Progetto, IZSLT con la sua DO Diagnostica Generale CRN-AR e NRL-AR, aveva anche organizzato un Workshop (23-24 ottobre 2017) e un Training Course (25-27 ottobre 2017) interno al Consorzio dei partners su aspetti di genomica e di epidemiologia molecolare basati sull’uso estensivo di metodologie di Next Generation Sequencing e Analisi Bioinformatica applicata ad agenti trasmissibili lungo le filiere alimentari e antibioticoresistenza correlata
